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Rcpp和RcppArmadillo创建R语言包的实现方式

发布时间:2021-11-07 13:11:12 所属栏目:教程 来源:互联网
导读:目录 1. 预先准备源文件示例func.cpp头文件示例test_h.h2. 创建R包步骤新建R PackageR包的文件结构修改DESCRIPTION文件3. C++11标准问题 1. 预先准备 Windows下需要安装Rtools,R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp,自定义头文件test_h.h。
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1. 预先准备源文件示例func.cpp头文件示例test_h.h2. 创建R包步骤新建R PackageR包的文件结构修改DESCRIPTION文件3. C++11标准问题
1. 预先准备
Windows下需要安装Rtools,R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp,自定义头文件test_h.h。
 
源文件示例func.cpp
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
#include <RcppArmadillo.h>
#include <vector>
#include "./test_h.h"
 
using namespace Rcpp;
using namespace std;
// using namespace arma;
 
// [[Rcpp::export]]
RObject func(){
  arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);
  std::cout<<CONDIT<<std::endl;
  return wrap(A);
}
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]:用于指明需要使用RcppArmadillo。
 
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用C++11。
 
#include "./test_h.h":表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""包括起来,并加上.h。./表示在当下文件夹(src)下搜寻文件。
 
// using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的数据结构,在其之前需指明arma::。
 
func()函数将可以直接在R中调用。
 
头文件示例test_h.h
 
 
#include <iostream>
#define CONDIT 1000
2. 创建R包步骤
新建R Package
1
 
选择Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手动复制到src文件夹下。
 
2
 
R包的文件结构
这里写图片描述
 
修改DESCRIPTION文件
将RcppArmadillo添加进Imports和LinkingTo中。
 
Package: RcppPackTest
Type: Package
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Author: Who wrote it
Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>
Description: More about what it does (maybe more than one line)
    Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
License: What license is it under?
Encoding: UTF-8
LazyData: true
Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo
Build & Reload 建立包
 
3. C++11标准问题
如果要使用C++11标准,第一种方法是在Makevars文件中添加如下代码:
 
CXX = g++-4.8.1
PKG_CXXFLAGS = -std=c++11
第二种方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

(编辑:南平站长网)

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